新疆农科院吐鲁番农业科学研究所（吐鲁番市农业科学研究院）隶属新疆农业科学院。创建于1975年，地处驰名中外的葡萄、瓜果之乡吐鲁番市境内，是吐鲁番地区从事葡萄栽培、葡萄酒研究、棉花栽培的专业研究机构。2000年被国家农业部确认为全国五十家重点地区农科所之一。有一批优秀的学科带头人和专业技术骨干。在作物栽培及酒加工酿造等学科研究方面有较强的优势，技术力量雄厚。